Die SEPA-Lastschrift ist in DAVOweb integriert. Es können SEPA-Lastschrift-Mandate verwaltet und die sogenannten xml-Lastschrift-Dateien erstellt werden. Diese Dateien werden bereitgestellt, um sie anschließend online an die Bank zu übermitteln oder in eine Homebanking-Software zu importieren und auszuführen.